.cram Fil
Filtyp Compressed Alignment File
| Utvecklare | EBI |
| Kategori | Data filer |
| Format | Binary |
.CRAM alternativnummer
Komprimerat anpassningsfilformat utvecklat av EBI, en utstationering av European Molecular Biology Laboratory; lagrar korta DNA-sekvensläsjusteringar genererade från kortläsningsinriktare såsom BWA, BBMap och BLAT.
Filformatet CRAM liknar filformatet Binary Alignment / Map (BAM) men har bättre filkomprimering och ett omstrukturerat kolumnorienterat binärt containerformat. När datamängderna ökar i det genetiska programfältet, var CRAM-formatet utformat för att minska diskfotens utskrift av justeringsdata.
Kortläsning är processen för att dechiffrera var en sekvens kommer från genomet. Detta kan vara svårt eftersom referensgenomet är ganska stort och du letar inte alltid efter exakta matchningar i referensgenomet. Kortläsningsjusteringar används för att söka enorma sekvenser för matcher och närmaste matchningar. Eftersom sekvenserna är så stora är komprimering som tillhandahålls av format som CRAM nödvändigt för att hålla filstorleken hanterbara.
| Windows |
|