.plugga Filtillägg
Filtyp Komprimerad inriktningsfil
Utvecklaren | EIB |
Kategori | Datafiler |
bildad | Binary |
.CRAM alternativnummer
Komprimerat anpassningsfilformat utvecklat av EBI, en utstationering av European Molecular Biology Laboratory; lagrar korta läsjusteringar av DNA-sekvenser genererade från korta läsjusteringar såsom BWA, BBMap och BLAT.
CRAM-filformatet liknar filformatet Binary Alignment / Map (BAM), men har bättre filkomprimering och ett omstrukturerat kolumnorienterat binärt containerformat. När data ökar inom det genetiska mjukvaruområdet, utformades CRAM-formatet för att minska diskutskrift av inriktningsdata.
Kortläsningsanpassning är processen att dechiffrera var en sekvens kommer ifrån i genomet. Detta kan vara svårt eftersom referensgenomet är ganska stort och man inte alltid söker efter exakta matchningar i referensgenomet. Kortläsjusteringar används för att söka i stora sekvenser efter matchningar och nära matchningar. Eftersom sekvenserna är så stora är komprimering som tillhandahålls av format som CRAM nödvändig för att hålla filstorlekarna hanterbara.
Windows |
|