#
Städer har ett antal distinkta mikroorganismer som gör att varje storstad har sina egna fingeravtryck, ett slags DNA som hjälper till att identifiera var du bor.
Alla städer har sina egna fingeravtryck. Detta upptäcktes i en ny studie av forskare som tog tusentals prover från kollektivtrafiken i 60 storstäder runt om i världen. Varje plats är befolkad av en unik uppsättning mikrobiella organismer som ger området ett slags distinkt DNA som gör att det är ganska troligt att du kan identifiera var du bor genom avtrycket på din sko.
Städernas fingeravtryck
För att identifiera varje stads "fingeravtryck" togs provtagningar på olika kontaktpunkter, till exempel vändkors och räcken på överfulla tunnelbanor eller busstationer. Över 4 700 prover som samlades in genomgick metagenomisk sekvensering, vilket innebär att man studerar genetiskt material som samlats in från miljön, och forskarna skapade en global atlas över det urbana mikrobiella ekosystemet som kan bli den första systematiska katalogen i sitt slag.
Resultaten skulle visa att ingen stad är den andra lik, och att varje storstad som analyserats har en unik molekylär ekologi hos de mikrobiella arter som bor där, som skiljer sig från populationer som finns i andra stadsmiljöer. Under tre års studier identifierades dessutom tusentals tidigare oidentifierade mikroorganismer, däribland nästan 11 000 virus och mer än 1 300 bakterietyper som inte motsvarade någon känd art.
Projektet inleddes med att analysera mikrobiologiska prover från New Yorks storstadsområde och har sedan dess expanderat till 32 länder på sex kontinenter och involverat dussintals forskare från mer än 60 forskningsorganisationer. Systembiologen Christipher Mason vid Cornell University grundade därför MetaSUB, ett internationellt samarbete som försöker dokumentera den urbana livsmiljö som miljontals människor interagerar med varje dag.
"Det är uppenbart att städer generellt sett påverkar människors hälsa, även om mekanismerna för denna påverkan varierar kraftigt och ofta är dåligt förstådda", skriver forskarna i sin nya studie. "Vår förståelse av mikrobiologisk dynamik", förklarade de, "i ett urbant sammanhang, utanför pandemier, har bara börjat".
Forskningens svabbprover samlades faktiskt alla in innan den hälsokris som orsakades av Covid-19 började och visade att av 4 728 metagenomiska prover i majoriteten av fallen hade okända mikrober. Totalt identifierades 10 928 virus, 1 302 bakterier, 2 arkéer och 838 532 CRISPR-arrays, eller fragment av virus-DNA, som inte hade någon matchning i referensdatabaserna.
Forskarna sade att en rad 31 arter av icke-mänskliga mikrober hittades i 97 % av proverna. Med denna studie hoppas forskarna kunna upptäcka nya sätt att identifiera hälsohot i mikrobiella populationer, till exempel antibiotikaresistenta bakteriestammar.
När det gäller Covid-19 har dock Spike-proteinet förvandlats till musik av MIT, där Markus Buehler skapade symfonin "Antibody Protein in E Minor".