Prism ger dig möjlighet att spara projektet i PZF, .PZFX och kompakta PZF-format. PZF-filen lagras i ett binärt format och var det primära formatet fram till version 5 av Prism då den ersattes av PZFX-formatet. Det finns flera fördelar med att spara i PZFX-format, men det har förekommit rapporter om problem med att öppna e-postade PZFX-filer som har lösts genom att spara Prism-data i det äldre PZF-formatet. Dessutom stöder nuvarande versioner av Prism fortfarande PZF-formatet. Det kompakta PZF-formatet är ett annat alternativ, eftersom det låter dig spara Prism-projektet i PZF-formatet, men utan analysresultaten (för att spara utrymme), som måste beräknas om när du öppnar filen.
GraphPad Prism används främst av biologer, studenter och fysikaliska och samhällsvetare vid universitet, vårdcentraler och läkemedelsföretag över hela världen. Programmet innehåller vetenskapliga grafiska verktyg, icke-linjär regressionskurvaanpassning och biostatistik för att analysera data och generera grafer som kan publiceras på webbplatser, . Docx filer och .PPTX filer.