Prism ger dig möjlighet att spara ditt projekt i PZF, .PZFX och Compact PZF format. PZF-filen sparas i ett binärt format och var det primära formatet till version 5 av Prism när den ersattes av PZFX-formatet. Det finns flera fördelar att spara i PZFX-format, men det har rapporterats om problem med att öppna PZFX-filer som skickats via e-post som har åtgärdats genom att spara prisma data i det äldre PZF-formatet. Även nuvarande versioner av Prism stöder fortfarande PZF-formatet. Det kompakta PZF-formatet är ett annat alternativ eftersom det låter dig spara ditt Prism-projekt i PZF-format men utan anlysis-resultaten (för att spara utrymme), vilket måste rekomputeras när filen öppnas.
GraphPad Prism används främst av biologer, studenter och fysiska och sociala forskare vid universitet, medicinska centra och läkemedelsföretag runt om i världen. Applikationen innehåller vetenskapliga grafverktyg, icke-linjär regressionskurvanpassning och biostatistik för att analysera data och generera grafer som kan publiceras till webbplatser, .DOCX files och .PPTX files.